料金について：
ファイアウォールログ取得数を1,000件→100,000件に変更した場合、1,000円/月が発生します。
同じ月内で、100,000件→1,000円に変更しても100,000件分の料金となり1,000円/月のまま変わりません。
再度、100,000件に変更しても料金は変わらず1,000円/月です。
同じ月内に何度設定を変更しても1,000円/月の料金となります。

閲覧できる件数について：
ログの件数を100,000件→1,000件に変更した場合、変更したタイミングで1,001件以上は閲覧できなくなりますが、即時に削除されることはありません。
再度、上限を 1,000件→100,000件に変更した場合、ログの件数が100,000件を超えていない
場合に限り、再び閲覧できるようになります。

ご参考
仕様・機能【ファイアウォール】
https://pfs.nifcloud.com/service/fw.htm
仕様・機能【料金】
https://pfs.nifcloud.com/price/
クラウドヘルプ【ファイアウォールの設定変更】
https://pfs.nifcloud.com/help/fw/change.htm